- Instituto de estudos comparados em administração e conflitos (INCTINEAC)
- Física Nuclear e Aplicações (INCT-FNA)
- Instituto de Ciência e Tecnologia em Disputas e Soberania Informacionais (INCT-DSI)
- INCT da Criosfera (laboratório associado)
- Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Biologia Estrutural e Bioimagem (laboratório associado)
- INCT Proprietas
- INCT (In) Atividade Física e Exercício
- Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Nanomateriais de Carbono (INCT Nanocarbono)